На базе Республиканского Центра медицинской профилактики функционирует еще одно единственное в своем роде отделение — врачебно-физкультурное отделение. Оно предназначено для медицинского обеспечения лиц, занимающихся физической культурой и спортом.

На сегодняшний день на диспансерном учете в диспансере состоят 4500 спортсменов республики, в том числе именитые чемпионы России и мира, члены сборных команд, учащиеся ДЮСШ. Врачи диспансера осуществляют выезда в спортивные школы с целью обследования детей и взрослых, занимающихся физической культурой и спортом, а также принимают участие в медицинском обслуживании спортивных соревнований в регионе».